Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms