Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms