Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Y2

ZNF444, Zinc finger protein 444, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444Q8N0Y2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF444Q8N0Y2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF444Q8N0Y2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms