Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RAB11FIP4Q86YS3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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