Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms