Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAL3Q7RTP6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms