Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM5Q71RC9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms