Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP43Q70EL4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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USP43Q70EL4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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USP43Q70EL4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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USP43Q70EL4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP43Q70EL4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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