Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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