Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC129Q6ZRS4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms