Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms