Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP12Q6UXS9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP12Q6UXS9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms