Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms