Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms