Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC174Q6PII3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC174Q6PII3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms