Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms