Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6P435 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6P435 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6P435 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6P435 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6P435 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6P435 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6P435 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6P435 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6P435 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6P435 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6P435 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6P435 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms