Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD54Q6NXT1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms