Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102BQ68D86 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms