Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms