Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CARMIL1Q5VZK9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms