Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1TD1Q5T7N2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms