Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRN2

C6orf10, Uncharacterized protein C6orf10, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf10Q5SRN2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf10Q5SRN2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms