Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A3Q5K4L6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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