Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC93Q567U6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms