Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP100Q494V2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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