Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF1Q3BBV0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms