Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms