Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETM2Q2VYF4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LETM2Q2VYF4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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