Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FXNQ16595 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FXNQ16595 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FXNQ16595 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FXNQ16595 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FXNQ16595 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FXNQ16595 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FXNQ16595 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FXNQ16595 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FXNQ16595 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FXNQ16595 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FXNQ16595 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FXNQ16595 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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