Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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RPE65Q16518 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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RPE65Q16518 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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