Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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