Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK3Q16288 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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