Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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