Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRNA2Q15822 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA2Q15822 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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