Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCOA1Q15788 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA1Q15788 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms