Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms