Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HMGN3Q15651 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HMGN3Q15651 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HMGN3Q15651 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HMGN3Q15651 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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HMGN3Q15651 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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