Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NKX1-1Q15270 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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