Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PCM1Q15154 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PCM1Q15154 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PCM1Q15154 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PCM1Q15154 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PCM1Q15154 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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PCM1Q15154 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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PCM1Q15154 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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PCM1Q15154 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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PCM1Q15154 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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PCM1Q15154 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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PCM1Q15154 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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