Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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