Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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