Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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