Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms