Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms