Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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