Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBFBQ13951 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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