Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms