Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TUBA3CQ13748 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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