Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1SQ13698 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
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